微生物育種就是指培育優(yōu)良微生物的生物學(xué)技術(shù)。其方法通常為自然選育和人工選育兩類，可單獨(dú)使用，也可交叉進(jìn)行。其中自然選育是對(duì)自然界的微生物，未經(jīng)人工誘變或雜交處理的情況下進(jìn)行分離和純化。人工選育分為誘變育種和雜交育種兩種。
應(yīng)用：
1.在酶制劑菌種選育中的應(yīng)用：酶制劑是活的有機(jī)體產(chǎn)生的有催化活性的蛋白質(zhì)，是所有新陳代謝過(guò)程的要素。應(yīng)用原生質(zhì)體誘變技術(shù)對(duì)酶制劑的生產(chǎn)菌株進(jìn)行誘變，已經(jīng)獲得了許多高產(chǎn)菌株。
2.抗生素高產(chǎn)菌種選育中的應(yīng)用：抗生素是微生物細(xì)胞的次級(jí)代謝產(chǎn)物，主要采用微生物發(fā)酵法進(jìn)行生物合成。由于生產(chǎn)菌種產(chǎn)量的高低受多步代謝調(diào)控的制約，高產(chǎn)菌株的選育也很困難。原生質(zhì)體誘變作為一種誘變技術(shù)，在抗生素的高產(chǎn)菌種選育中已有著廣泛的應(yīng)用。
3.在氨基酸、生產(chǎn)溶劑及有機(jī)酸菌種選育中的應(yīng)用：氨基酸是生物功能大分子蛋白質(zhì)的基本組成單位，在食品、飼料、醫(yī)藥、化學(xué)工業(yè)、農(nóng)業(yè)等行業(yè)中應(yīng)用廣泛，各國(guó)都在大力發(fā)展氨基酸生產(chǎn)。發(fā)酵法已成為氨基酸生產(chǎn)的主要方法。因此選育高產(chǎn)菌株是氨基酸工業(yè)發(fā)展的重要方向。
4.生素菌種選育中的應(yīng)用：維生素是維持人和動(dòng)物生命活動(dòng)必需的、但不能自身合成的一類有機(jī)物質(zhì)，在生長(zhǎng)、代謝、發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮著重要的作用。
5.蟲(chóng)菌種選育中的應(yīng)用：蘇云金桿菌（B acillus thuringiensis）是從自然界中篩選出來(lái)的一大類細(xì)菌型微生物殺蟲(chóng)劑，多應(yīng)用于農(nóng)林害蟲(chóng)的防治中。
